R라딘

안녕하세요, factor에 대한 상관 관계 분석에 대한 포스팅이에요. 상관 관계 분석은 다양한 분야에 이용되곤 하는데요, 저는 주로 마이크로바이옴의 박테리아와 다른 환경인자 사이에서 분석을 하곤 합니다. RStudio의 이용 패키지는 "Hmisc"을 이용해요. 아래 Step에 따라 상관 관계 분석을 해봐요. 1. 패키지 설치 install.packages("Hmisc") install.packages("xlsx") 2. 패키지 실행 library(Hmisc) library(xlsx) 3. 계산 Matrix 설정 flattenCorrMatrix

Hello, This is about correlation analysis among factors. The correlation analysis used to lots of study fields. In my case, i used to analysis between microbiome and environmental factors. We used "corplot" and "PerformanceAnalytics" in Rstudio. You can follow up with following steps below. 1. Install Packages #+++++++++++++++++++++++++Install Packages++++++++++++++++++++++++++++++++++++# instal..

안녕하세요, 두 가지 팩터에 대한 상관 관계 분석에 대한 포스팅이에요. 상관 관계 분석은 다양한 분야에 이용되곤 하는데요, 저는 주로 마이크로바이옴의 박테리아와 다른 환경인자 사이에서 분석을 하곤 합니다. RStudio의 이용 패키지는 "corrplot" 이랑 "PerformanceAnalytics" 에요. 다음 스텝에 따라 없어도 있어 보이는 시각화 그림을 만들어 보세요. 1. 패키지 설치 #+++++++++++++++++++++++++Install Packages++++++++++++++++++++++++++++++++++++# install.packages("corrplot") install.packages("PerformanceAnalytics") 2. 패키지 실행 #++++++++++++++++..

There are milions case of error when install R packages. Most popular package install error with crush of Onedrive is posted in the other posting. The error of Package install with directory Lock problem will be posted in this time. This error can be noticed by "00LOCK" message during package install. See below. The reason of this error is that you probably force terminated the R program before...

R에서 패키지 설치의 오류 발생은 수 만 가지의 경우의 수가 있어요. 다른 포스팅을 보면, Onedrive의 충돌 Error를 다뤘었는데, 이번 포스팅에서는 패키지 설치하는 폴더에 Lock이 걸린 문제를 다룰게요. 패키지 설치 중, 아래 그림과 같이 "00LOCK" 뜨는 메세지 오류에요. 문제의 원인은 강제 종료로 인해서 패키지 설치하는 폴더나 특정 디렉토리에 Lock이 걸린 상황이에요. 가장 중요한 해결 방법을 알려드릴게요. 1. Lock 해제 options("install.lock"=FALSE) 2. 원하는 패키지를 다시 설치한다. install.packages("pheatmap") 참 쉽죠?

제주도 한국미생물학회 (MSK) 이야기 아침, 새벽에 도착한 김포공항 주차장. 옆 차는 새벽이슬을 많이 먹었다.. 이 시간에 도착하기 위해서 기상한 시간은 새벽 4시 반.. 출발도 전에 이미 피곤하다. 비행기를 많다면 많고 적다면 적은 횟수를 타보긴 했지만, 이렇게 영화처럼(?) 걸어서 올라가는 탑승은 처음이라 신기하다. 나를 목적지까지 무사히 잘 데려다 주길 바라요, 진에어님! 험난한 길을 돌아 도착한 서귀포의 ICC 제주 컨벤션센터 학회 일정, 생각보다 외쿡인이 많다! 오랜만에 막혔던 귀를 뚫어볼까 하는 기대감에 흥이 오른다. 심포지엄 강연 중 1개. 전반적으로 휴먼 마이크로바이옴 관련 내용이 요즘 굉장히 핫한 트렌드인가보다. 그런 내용들이 많은 학회였다. 그런 내용들만 찾아다녔던건 안비밀. 첫 날은..

Hello, Heatmap is one of the most frequently visualized method on SCI papers. This is the method how to heatmap visualize in Rstudio. 1. Install Packages # Install Library install.packages("stats") install.packages("gplots") install.packages("RColorBrewer") 2. Run Packages # Loads Library library(stats) library(gplots) library(RColorBrewer) 3. Set the Heatmap color # Heatmap color scalegreenblue..

안녕하세요, 많은 논문에서 시각화로 쓰이는 방법 중 하나는 Heatmap이 있어요. Rstudio에서 data를 Heatmap으로 시각화하는 방법이에요. 1. 패키지 설치 # Install Library install.packages("stats") install.packages("gplots") install.packages("RColorBrewer") 2. 패키지 실행 # Loads Library library(stats) library(gplots) library(RColorBrewer) 3. Heatmap 색 설정 # Heatmap color scalegreenbluered=colorRampPalette(colors=c("white","chartreuse4","darkgreen","black"))..

Hello, There are several method of statistical analysis between groups such as ANOSIM, ANOVA, PERMANOSIM PERMANOVA. This Posting is about Analysis of Similiarity (ANOSIM). The interpretation of ANOSIM is well explained below of Google WIKIPedia. https://en.wikipedia.org/wiki/Analysis_of_similarities Theory, equation, interpretation, etc. Here is about how to statistically analysis the data by R ..

Hello, When you work on RStudio, you should notify which directory are you using. Because, the output files will be created on working directory. Here is the method of default setting of working directory. 1. Run the RStudio and you can see the below picture. Here you can set working directory by default. 2. Open the Global Option and fill in directory in R sessions where you want to get output ..