R라딘

안녕하세요, RStudio 작업할 때, 내가 어느 폴더에서 작업을 하고 있는지 반드시 인지하고 있어야 Output file이 어디 생성되었는지 알 수 있는데요. 이 번 포스팅은 Working Directory를 Default로 설정하는 방법에 대한 내용이에요. 1. R Studio를 실행시키면 오른쪽 아래 이런 칸이 보여요. 이 부분에서 Default 값으로 폴더를 지정할 수 있어요. 2. 상단 옵션 중에 아래와 같은 Global Option창에서 R sessions 아래 Default working directory를 설정해 주세요. 이 설정의 편리함은 R script 명령어를 저장해두고 바로 불러올 수 있다는 장점도 있어요. 3. 명령어로 설정하는 Working Directory getwd() #현재..

Hello, Beta-diversity is one of the mostly used analysis method in microbiome community composition study. Diversity has three kind of scale; Alpha-, Beta-, Gamma-. What is the difference? Simply, The group size are getting bigger from Alpha to Gamma. Alpha diversity is the diversity within a particular area or ecosystem; usually expressed by the number of species (i.e., species richness) in tha..

안녕하세요, R에서 데이터를 불러오면, header = TRUE & hearder = FALSE 이라는 문구를 종종 보입니다. 의미는 아래와 같아요. header = TRUE 행] 첫 줄을 변수로 입력하여 같이 가져온다. header = FALSE 행] 첫 줄 변수 없애고, 첫 줄부터 데이터로 가져온다. 간단하죠? header = FALSE를 입력하고, 첫 줄의 데이터로 가져온 다음, 변수 이름을 default 지정 할 수도 있어요. colnames(dataset)

Hello, When we input dataframe from R, header = TRUE & hearder = FALSE is frequently used. The meaning is below. header = TRUE Row] Fill in the data with first row as variables. header = FALSE 행] Fill in the data without first row as variables, and first raw will be data. It's pretty simply, right? After use the "header = FALSE", we can fill in variable names by default. colnames(dataset)

안녕하세요, Group간의 수치 차이를 통계 분석에는 대표적으로 ANOSIM, ANOVA, PERANOSIM, PERANOVA 등등이 있습니다. 이 번 포스팅에서는 Analysis of Similiarity (ANOSIM)에 대해 다뤄볼게요. 아래 Google WIKIPedia에 가면 설명은 너무 잘 되어있습니다. https://en.wikipedia.org/wiki/Analysis_of_similarities ANOSIM의 원리, 공식, 정의, 결과 값 해석이 기술되어 있습니다. 저는 R program에서 어떤 명령어를 사용하여 분석하는지 설명합니다. 패키지는 "vegan"을 이용합니다. 1. 패키지 설치 ################### Install Packages #################..

안녕하세요, 미생물 분석에 자주 이용되는 군집 분석 중 하나는 Beta-diversity 입니다. Diversity에도 종류가 있는데 Alpha-, Beta-, Gamma- Diversity가 있죠. 차이점은 무엇일까요? alpha에서 Gamma로 갈 수록 그룹 집단이 소규모에서 대규모로 간다고 이해하시면 됩니다. Alpha diversity는 생태계에서 특정 지역 내에서 다양성 분석이며, 주로 종 개수가 표현됩니다. Beta diversity는 종의 양 변화에 따라 측정 됩니다. Gamma diversity는 지역적 스케일로 다양성이 평가됩니다. 아래 코드는 Beta diversity에 관한 분석과 3D로 시각화 하는 방법입니다. 패키지는 "rgl"과 "car"라는 패키지를 이용합니다. 아래 총 8단계..

Hello, There are several automation programs. Ui.Path of Microsoft, Python, R, and Java etc.. Most of all, Ui.Path is only for automation program. Ui.Path will be posted in the future, and today automation with R will be posted. Firstly, Install R program and RStudio. Second, launch RStudio and install automation packages with command below. The Package name is "KeyboardSimulator" ##############..

안녕하세요, 업무 자동화에는 여러가지 프로그램이 있어요. Microsoft의 Ui.Path, Python, R, Java, 등등 모두 업무자동화를 활용할 수 있죠. 그 중에서도 Ui.Path의 경우 자동화만을 위한 프로그램이에요. Ui.Path에 관해서는 나중에 포스팅할 예정이고, 오늘은 R프로그램을 이용한 업무자동화 프로그램을 포스팅 할게요. 먼저, R프로그램과 R Studio를 설치합니다. R Studio가 열리면, 업무자동화를 위한 패키지를 설치해야겠죠? 아래와 같은 명령어를 통해서 패키지 설치를 합니다. 패키지 이름은 KeyboardSimulator 입니다. ########################패키지설치########################## if (!require("devtools..

Hello, Sometimes, Rstudio can not read dataframe with below error. invalid multibyte string at 'ȣ' What is the reason? Window use EUC-KR encoding, however Mac or Linux use UTF-8 encoding. Setting with UTF-8 is independent, and fixing method is typing is fileEncoding="euc-kr" when you input files with "read.table" below. data

안녕하세요, Rstudio에서 아래와 같이 데이터 프레임을 읽지 못하는 경우가 있어요. invalid multibyte string at 'ȣ' 원인이 무엇일까요? 윈도우의 경우 EUC-KR의 인코딩을 사용하는데, 맥이나 리눅스에서는 UTF-8을 이용하기에 발생하는 에러입니다. Script의 UTF-8 설정과는 별개이며, 해결방법은 read 객체의 method에서 인자로 fileEncoding="euc-kr"을 전달해주면 됩니다. data