R라딘

안녕하세요, 두 가지 팩터에 대한 상관 관계 분석에 대한 포스팅이에요. 상관 관계 분석은 다양한 분야에 이용되곤 하는데요, 저는 주로 마이크로바이옴의 박테리아와 다른 환경인자 사이에서 분석을 하곤 합니다. RStudio의 이용 패키지는 "corrplot" 이랑 "PerformanceAnalytics" 에요. 다음 스텝에 따라 없어도 있어 보이는 시각화 그림을 만들어 보세요. 1. 패키지 설치 #+++++++++++++++++++++++++Install Packages++++++++++++++++++++++++++++++++++++# install.packages("corrplot") install.packages("PerformanceAnalytics") 2. 패키지 실행 #++++++++++++++++..

There are milions case of error when install R packages. Most popular package install error with crush of Onedrive is posted in the other posting. The error of Package install with directory Lock problem will be posted in this time. This error can be noticed by "00LOCK" message during package install. See below. The reason of this error is that you probably force terminated the R program before...

R에서 패키지 설치의 오류 발생은 수 만 가지의 경우의 수가 있어요. 다른 포스팅을 보면, Onedrive의 충돌 Error를 다뤘었는데, 이번 포스팅에서는 패키지 설치하는 폴더에 Lock이 걸린 문제를 다룰게요. 패키지 설치 중, 아래 그림과 같이 "00LOCK" 뜨는 메세지 오류에요. 문제의 원인은 강제 종료로 인해서 패키지 설치하는 폴더나 특정 디렉토리에 Lock이 걸린 상황이에요. 가장 중요한 해결 방법을 알려드릴게요. 1. Lock 해제 options("install.lock"=FALSE) 2. 원하는 패키지를 다시 설치한다. install.packages("pheatmap") 참 쉽죠?

Hello, Heatmap is one of the most frequently visualized method on SCI papers. This is the method how to heatmap visualize in Rstudio. 1. Install Packages # Install Library install.packages("stats") install.packages("gplots") install.packages("RColorBrewer") 2. Run Packages # Loads Library library(stats) library(gplots) library(RColorBrewer) 3. Set the Heatmap color # Heatmap color scalegreenblue..

안녕하세요, 많은 논문에서 시각화로 쓰이는 방법 중 하나는 Heatmap이 있어요. Rstudio에서 data를 Heatmap으로 시각화하는 방법이에요. 1. 패키지 설치 # Install Library install.packages("stats") install.packages("gplots") install.packages("RColorBrewer") 2. 패키지 실행 # Loads Library library(stats) library(gplots) library(RColorBrewer) 3. Heatmap 색 설정 # Heatmap color scalegreenbluered=colorRampPalette(colors=c("white","chartreuse4","darkgreen","black"))..

Hello, There are several method of statistical analysis between groups such as ANOSIM, ANOVA, PERMANOSIM PERMANOVA. This Posting is about Analysis of Similiarity (ANOSIM). The interpretation of ANOSIM is well explained below of Google WIKIPedia. https://en.wikipedia.org/wiki/Analysis_of_similarities Theory, equation, interpretation, etc. Here is about how to statistically analysis the data by R ..

Hello, When you work on RStudio, you should notify which directory are you using. Because, the output files will be created on working directory. Here is the method of default setting of working directory. 1. Run the RStudio and you can see the below picture. Here you can set working directory by default. 2. Open the Global Option and fill in directory in R sessions where you want to get output ..

안녕하세요, RStudio 작업할 때, 내가 어느 폴더에서 작업을 하고 있는지 반드시 인지하고 있어야 Output file이 어디 생성되었는지 알 수 있는데요. 이 번 포스팅은 Working Directory를 Default로 설정하는 방법에 대한 내용이에요. 1. R Studio를 실행시키면 오른쪽 아래 이런 칸이 보여요. 이 부분에서 Default 값으로 폴더를 지정할 수 있어요. 2. 상단 옵션 중에 아래와 같은 Global Option창에서 R sessions 아래 Default working directory를 설정해 주세요. 이 설정의 편리함은 R script 명령어를 저장해두고 바로 불러올 수 있다는 장점도 있어요. 3. 명령어로 설정하는 Working Directory getwd() #현재..

Hello, Beta-diversity is one of the mostly used analysis method in microbiome community composition study. Diversity has three kind of scale; Alpha-, Beta-, Gamma-. What is the difference? Simply, The group size are getting bigger from Alpha to Gamma. Alpha diversity is the diversity within a particular area or ecosystem; usually expressed by the number of species (i.e., species richness) in tha..

안녕하세요, R에서 데이터를 불러오면, header = TRUE & hearder = FALSE 이라는 문구를 종종 보입니다. 의미는 아래와 같아요. header = TRUE 행] 첫 줄을 변수로 입력하여 같이 가져온다. header = FALSE 행] 첫 줄 변수 없애고, 첫 줄부터 데이터로 가져온다. 간단하죠? header = FALSE를 입력하고, 첫 줄의 데이터로 가져온 다음, 변수 이름을 default 지정 할 수도 있어요. colnames(dataset)